Ce pavillon de jardin est le seul vestige de la propriété située au bord de la Seine, acquise par le père de Flaubert en 1844. Flaubert, très attaché à cette demeure, y vécut durant 35 ans et y écrivit toute son œuvre. Dans le pavillon du bord de l’eau, il recevait ses amis Maupassant, Louis Bouilhet, George Sand, les Frères Goncourt...
La propriété fut vendue peu de temps après la mort de Flaubert en 1880, et détruite. Une souscription, ouverte en 1904, permit de racheter le Pavillon et de le transformer en musée. Celui-ci fut inauguré en 1906.
On peut y voir des objets d’écriture de Flaubert - plumes d’oie, encrier- des portraits et dessins, des vues et gravures du Croisset de l’époque, des objets qui se trouvaient dans son cabinet de travail, comme le fameux Bouddha doré.